منطقه حفاظت شده جاجرود به خاطر داشتن آب و هوای بسیار خوب و زیست بوم عالی به یکی از بی بدیل ترین نقاط ایران مبدل شده است. این منطقه در استان یکی از خوش آب و هواترین مناطق ایران است که با داشتن تنوع بسیار زیاد گونههای جانوری و گیاهی از دیرباز مورد توجه بوده است. کوههای منطقه حفاظتشده جاجرود به صورت پراکنده هستند و این منطقه به دلیل نزدیکی به ناحیه گرمسیری ورامین از یک سو و تاثیر از ارتفاعات البرز مرکزی از سوی دیگر و به دلیل داشتن پستی و بلندیهای فراوان از نظر پوشش گیاهی سیمای متفاوتی دارد. پوشش گیاهی استپی بیشتر کوهپایهها و دامنه کوهها را پوشانده است. بقایای جنگلهای بنه در ارتفاعات و تپه ماهورهای ارتفاعات باغشاه تا حدود یورد قشقایی و کریم چشمه جنوب یال زیرک چال نیز بهطور نامنظم پراکندهاند و گونههایی نظیر زالزالک، گوجه وحشی، زرشک، انجیر، شیرخشت و بادامک نیز بهطور پراکنده مشاهده است. همچنین در قسمتهایی از پارکملی خجیر و در ارتفاعات و در شیب دامنهها مانند سروکوه، زیرک چال بارجمالی درخت ارس نیز بهطور پراکنده به چشم میخورد. یکی دیگر از ویژگیهای این منطقه تلاقی رودخانه جاجرود و دماوند در این منطقه میباشد.